根據農委會統計，2006年底台灣野生物種共有5,503種（包括植物4,131種、動物1,372種），較2005年底增加32種，而且其中有1,285種是台灣特有物種，占台灣野生物種數的23.4%，顯示台灣生態資源相當豐富。

不過，由於台灣持續進行開發，威脅到野生物種生存環境，2006年底，面臨生存威脅物種數達571種，較2005年底增加38種；更有175種物種面臨滅絕之虞，較2005年底增加了一種。

為使台灣物種在自然狀況下生存、繁衍，2006年底國內已劃設自然保護區80處，較十年前增加八處，自然保護區面積高達70萬2796公頃，較十年前大幅增加53.2%，換算下來，平均每千人擁有30.72公頃自然保護區，較十年前增加9.4公頃。

目前台灣的自然保護區中，野生動物保護區有2萬5828公頃，較十年前增加五倍，野生動物重要棲息環境則高達32萬2267公頃，較十年前大幅增加41.8倍；但國有林自然保護區僅2萬1172公頃，較十年前大幅減少86.1%，自然保留區及國家公園面積則分別為6萬4477公頃及32萬2845公頃，與十年前相當。（記者鄭琪芳）